Địa bàn xã Hạnh Phúc hiện nay trước đây vốn là hai xã Hạnh Phúc và Hồng Định thuộc huyện Quảng Uyên.

Ngày 9 tháng 9 năm 2019, sáp nhập một số xóm thuộc hai xã Hồng Định và Hạnh Phúc.[3]

Trước khi sáp nhập, xã Hạnh Phúc có diện tích 25,39 km², dân số là 2.923 người, mật độ dân số đạt 115 người/km², có 9 xóm: Bản Tin - Lũng Tao, Bình Linh, Bó Huy, Bản Hoán, Bản Khau, Lũng Luông, Nà Bó, Nà Luông, Thôm Đán. Xã Hồng Định có diện tích 16,19 km², dân số là 2.319 người, mật độ dân số đạt 143 người/km², có 6 xóm: Hồng Định I, Hồng Định II, Hồng Định III, Hồng Định IV, Hồng Định V, Hồng Định VI.

Ngày 10 tháng 1 năm 2020, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 864/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp huyện, cấp xã thuộc tỉnh Cao Bằng (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 2 năm 2020)[2]. Theo đó, sáp nhập toàn bộ diện tích và dân số của xã Hồng Định vào xã Hạnh Phúc.

Ngày 1 tháng 3 năm 2020, huyện Quảng Uyên giải thể để tái lập huyện Quảng Hòa[4]. Xã Hạnh Phúc thuộc huyện Quảng Hòa như hiện nay.